L’Homme a joué un rôle considérable dans la biodiversité à travers la domestication de la faune et de la flore. Il a sélectionné au cours de l’histoire des génotypes qu’il considérait comme plus intéressants pour sa survie ou ses besoins accessoires. Paradoxalement, l’Homme crée de la biodiversité par différents procédés (hybridation, OGM...) mais en parallèle, sur le territoire, il n’utilise qu’un petit nombre d'espèces. Au niveau de l'agriculture, il s'opère une sélection extrêmement forte, qui tend vers une homogénéisation des génotypes. Ainsi, 50 % des productions végétales correspondent à seulement quatre espèces différentes.